As linhas de pesquisa do programa, em um total de nove, estão distribuídas em três áreas de concentração:

 

1. Manejo do Solo e da Água

1.1. Dinâmica da Matéria Orgânica do Solo
1.2. Manejo Sustentável do Solo e Água

1.3. Solos Afetados por Sais


2. Pedologia

2.1. Gênese e Classificação do Solo
2.2. Levantamento de Solos e Sistemas de Informações Geográficas

2.3. Mineralogia e Geoquímica do Solo


3. Química, Fertilidade e Biologia do Solo

3.1. Associações Biológicas no Sistema Solo-Planta
3.2. Fertilidade do Solo, Adubação e Nutrição de Plantas
3.3. Química e Poluição do Solo